 植物园内主要水系椎溪和水磨坑溪从东至西贯穿全园。发源于五老峰北麓的椎溪蜿蜒曲折，流过紫云岩，经百花厅后进入西北部的万石湖，万石湖最大蓄水量14.7万立方米，主要靠雨季山洪的汇集，是万石山最大水体。 植物资源 厦门园林植物园自1960年建园至2014年，厦门植物园已引种、收集7000多种(含品种)植物，建成了松杉园、蔷薇园、竹径、棕榈岛、沙生植物区、南洋杉疏林草地、雨林植物世界、藤本植物区、花卉园、药用植物区、彩叶灌木区、百花厅、苏铁园、引种驯化区、市花园等15个专类园区。 在厦门园林植物园拥有的各类植物资源中该园的棕榈科植物资源是最具特色的，已经引种驯化了各类棕榈植物500余种，是我国引种栽培棕榈植物资源最多的机构之一，包括加拿利海枣、大王椰子、砂糖椰子等。 不仅仅是棕榈植物，厦门园林植物园还有仙人掌与多肉植物2000余种、藤本植物约200种、竹类植物200多种、苏铁科100多种、南洋杉科11种、市花三角梅100多个品种，形成以热带、亚热带植物为主的植物特色，并有多个植物类群在全国植物园中名列前茅。值得一提的是，这其中，还有金花茶、桫椤、笔筒树、银杏、水杉、红豆杉、苏铁等200多种珍稀保护植物。 |
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