 分布于三清山的北西、北东部，为由南华系—志留系沉积盖层组成的北东向侏罗山式褶皱。在区域上本期褶皱常被侏罗纪以来的地层不整合覆盖，故推断其应为印支期褶皱。主要有: （1）黄土岭复式背斜：位于三清山北西部的黄土岭一带，属于区域上的黄土岭—开化复式背斜的一部份，其轴线走向北东，褶皱向北东倾伏、向南西撒开，区内延长约15km。轴面近直立，两翼产状比较紊乱，北西翼产状较陡，为300~350°∠30~75°，南东翼产状较缓，为120~150°∠30~60°。核部地层为南华纪地层，翼部地层由震旦纪—奥陶纪地层组成。南翼出露较广泛，常形成一些次级背向斜构造。 （2）华眉山向斜：分布于三清山的北东部，其轴线走向北东—南西向，其南西端起于怀玉山岩体旁侧，北东端经源头向区域上延伸，轴线走向67°，北西翼略陡，倾角40°~60°，南东翼较缓，倾角30°~50°。核部地层为早奥陶世印渚埠组，翼部由晚寒武世地层组成 |
| 若以形态量计（比高和发布面积百分数）特征为划分依据，可将三清山花岗岩地貌划分为以下4种地貌区： （1）强烈中切割中山地貌区：以玉京峰为中心，从其南西的云盖峰一直延伸至其北东的大坞头一带均属此地貌区，海拔1000~1800m，1000m以上的山峰也占到山体总面积的1/3，切割深度数百米至千余米，切割程度>50%。 （2）强烈浅切割低山地貌区：鹅公岭-王山、上横坦—大源坞、酒盏地-上西坑等地均属此地貌区，海拔500~1000m，切割深度100~500m，切割程度达50%。 （3）微弱浅切割高丘地貌区：分布于枫林、中坑、双溪、汾水等地，海拔300~500m，只有少数山头超过500m，切割深度100~200m左右，切割程度<20%。坡度较缓，沟谷短浅，呈V形，山脊东西走向，形态浑圆。 （4）微弱浅切割低丘地貌区：范围较小，分布于地质公园南部枫林、中坑一带，海拔200~300m，切割深度60~150m左右，切割程度<20%。沟谷短浅，丘顶形态浑圆。 |
| 三清山地区岩浆岩活动较频繁，岩浆岩分布较广泛，其岩浆岩主要为 超酸性侵入岩，即燕山晚期形成的三清山花岗岩体（属怀玉山岩体的一部分），构成了三清山的主体。三清山花岗岩体位于三清山山体的中心部位，其平面形态呈不规则状，在山体内出露面积约98km2。花岗岩侵入于黄土岭复式背斜南翼的南华纪—奥陶纪地层中，呈岩基、岩株状产出，侵入接触界线不规则，呈波状、港湾状或枝叉状，接触面产状倾向围岩。内接触带见1~3cm宽的致密坚硬的细晶冷凝边，岩体中残留顶盖常见，为浅剥蚀程度。外接触带具较强的热接触变质作用，形成宽500~2000余米的热接触变质晕。岩体内原生流动构造不发育，继承性脉岩发育，主要有花岗细晶岩、伟晶岩、花岗斑岩、闪长玢岩及辉长辉绿岩脉等。岩体内常见较多大小不等，形态不规则的暗色矿物相对富集闪长质包体。围岩蚀变主要有矽卡岩化、硅化及绿泥石化等。岩体主要矿物成分为钾长石、斜长石、石英、黑云母等。 |
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