(1)庇奥.克里门提诺美术馆(Museo Pio-Clementino):以希腊罗马时代的雕刻最为精彩,名作有「克尼多斯的维纳斯」(Venus of Cnidus)、「沉睡的阿莉亚多尼」(Sleeping Ariadne)、「望楼的阿波罗」(Appool Belvedere)、「劳孔」(Laocoon)、以及「望楼的躯干雕像」(Male Torso)等。 (2)伊突利亚美术馆(Museo Gregoriano-Etrusco):以公元前四世纪前的收藏品为主,重要作品有公元前五世纪赤土制的「飞马」、公元前七世纪伊突利亚的青铜「特迪的战神像」、以及公元前四世纪的「黑像式双耳壶」(Black-Figure Amphora)等。
(3)拉斐尔诸室: 1.署名室(Stanza della Segnatura),是以天花板壁画「雅典学园」(The School of Athens)驰誉于世,是拉斐尔在25岁左右的作品,四幅主画为:「圣体的争论」、「雅典学园」、「三大德性」和「帕纳索斯山」 (Parnassus) 。 2.艾略多罗室(Stanza di Eliodoro)的作品以表现神意和奇迹的主题为焦点,「希略多拉斯的放逐」 (Expulsion of Heliodorus from the Temple)描绘耶路撒冷遭略夺的景象、「波塞纳的神奇弥撒」则表现足与提香媲美的色彩光辉。 ※拉斐尔回廊内的画作取材于旧约圣经,因此又被称为「拉斐尔的圣经」。回廊内最著名的画作为「波尔哥的火灾」(Fire in the Borgo)。